Пользу от иммунотерапии рака теперь легче предсказать
Иммунотерапия, в отличие от химиотерапии, которая убивает раковые клетки, помогает иммунной системе организма самостоятельно находить и уничтожать раковые клетки.
Исследователи объединили данные шести предыдущих исследований иммунотерапии. Но даже после этого количество пациентов - всего 319 человек - все равно было относительно небольшим.
Чтобы обойти эту проблему, исследователи обратились к модели под названием fishHook. Она корректирует ряд факторов, которые влияют на частоту фоновых мутаций - например, корректирует размер гена, поскольку в больших генах вероятность мутаций выше.
Используя эту модель, исследователи применили двухэтапный подход: сначала они изучили результаты секвенирования всех пациентов, чтобы найти гены с более высоким мутационным бременем, чем ожидалось, с поправкой на геномные факторы. В результате было выявлено шесть генов с подозрительно высоким мутационным бременем.
Затем исследователи определили, были ли какие-либо из этих шести генов повышены у людей, которые отвечали или не отвечали на иммунотерапию. Используя тот же двухэтапный подход к набору генов, называемых путями, исследователи определили, что определенные пути также предсказывают ответ на ингибиторы иммунных контрольных точек.
Затем они объединили четыре гена и три пути с другими прогностическими переменными, такими как возраст, тип опухоли и мутационное бремя опухоли, чтобы создать инструмент, который они назвали CIRCLE. По итогу он смог лучше предсказать ответ на иммунотерапию примерно на 11%, чем позволяли прошлые методы. CIRCLE также смог точно предсказать выживаемость рака после иммунотерапии.