Нейросети могут до 500 раз ускорить разработку новых лекарств
Но все еще впередиИх метод в 80-500 раз быстрее, чем современные программы, и часто предсказывает белковые структуры, которые ближе к реальным структурам, наблюдаемым экспериментально.
Разработанная исследователями модель, названная Equidock, ориентирована на стыковку жестких тел, которая происходит, когда два белка соединяются путем вращения или перемещения в трехмерном пространстве, но их формы не сжимаются и не изгибаются.
Одной из самых больших трудностей при построении этой модели было преодоление недостатка обучающих данных. Поскольку существует так мало экспериментальных 3D-данных по белкам, было особенно важно включить в Equidock геометрические знания, говорит один из авторов работы.
После того как модель была обучена, исследователи сравнили ее с четырьмя программными методами. Equidock способен предсказать конечный белковый комплекс всего за одну-пять секунд. Все существующие методы требуют гораздо больше времени - от 10 минут до часа и более.